Используя эту схему можно организовать либо обмен через XML файл (в частности для инициационной выгрузки) либо использовать через WS-ссылки и/или Web-сервисы (ETL -> push/pull). Сюда же можно добавить регламентные задания и планы обмена для организации более гибких схем.

Со стороный MS SQL: для инициационной загрузки и организации «Pull me» схемы — использовать SSIS.
Для организации «Push me» схемы -> WCF. Наверно можно использовать и Native XML Web services — но из-за его нынешнего статуса не совсем целесообразно (в общем я и не пробовал).

PS> ну и на последок — забить немного про «All in one» идеологию 1С. Вооружится книгами типа: http://www.books.ru/shop/books/479716 http://www.soabooks.com/